在重金属防治方面，内蒙古2013年计划完成的8个重点重金属污染综合防治项目已全部完成。
此外，完成了1个国家《重金属污染综合防治“十二五”规划》项目和1个自治区规划项目建设和验收工作；3个重点防控区均完成了年度排放量目标任务；全区6个城镇集中式地下饮用水水源中重点重金属污染物全部达标。
在重点流域水污染防治方面，内蒙古涉及松花江、辽河、海河和黄河中上游4个流域共25个考核断面，其中由内蒙古监测的考核断面共22个，其余3个考核断面由相邻省份监测。25个考核断面中，松花江流域共9个考核断面，内蒙古监测的8个考核断面，水质目标为Ⅲ类。
2013年监测结果表明，阿伦河新发断面水质达标率为90%，其余断面水质达标率为100%。辽河流域4个考核断面中，东山湾断面水质目标为Ⅲ类，其余断面水质目标均为Ⅳ类；东山湾断面水质达标率为88.9%，其余两个断面水质全部达到Ⅳ标准。海河流域两个考核断面中，锡林郭勒盟滦河大河口水质目标为Ⅲ类，断面水质达标率为100%。
